ژنوتایپینگ جدایه های سودوموناس آئروژینوسای جدا شده از عفونت های بیمارستانی

سابقه و هدف: سودوموناس آئروژینوسا یک پاتوژن فرصت طلب شایع بیمارستانی است که مسئول طیف وسیعی از عفونت‌های انسانی می‌باشد. مطالعه حاضر با هدف دسته بندی ژنتیکی جدایه های سودوموناس آئروژینوسا جدا شده از عفونت های بیمارستانی انجام شد. مواد و روش ها: این مطالعه مقطعی توصیفی بر روی 18 جدایه سودوموناس آئروژینوسا جداسازی شده از بیماران بستری در بیمارستان های سطح شهرستان شهرکرد انجام گرفت. به منظور ژنوتایپینگ آن ها از سه روش RAPD-PCR، ERIC-PCR و Rep-PCR استفاده گردید.یافته ها: در آزمون RAPD-PCR، 86 باند مختلف DNA از حدوداً 300 تا 10000 جفت باز در جدایه های مورد بررسی ایجاد شد. از این میان تعداد 74 باند از آن ها پلی مورفیک بود. در آنالیز جدایه های سودوموناس آئروژینوسا با روش ERIC-PCR تعداد 98 باند مختلف با حدود 150 تا 8000 جفت باز مشاهده شد که الگوی باندینگ 14 جدایه از 18 جدایه مورد بررسی پلی مورفیک بود. در آزمایش Rep-PCR، 16پروفایل ژنومی حاصل گردید که در مجموع شباهتی بین حدود 30 تا 86 درصد بین جدایه ها مشاهده شد و تعدادی از نمونه ها دارای شباهت 100 درصد بودند. نتیجه گیری: به طور کلی تمام جدایه های مورد بررسی دارای الگوی باندی پلی مورفیک بودند. هیچ باند مونوفورمیکی در جدایه ها مشاهده نشد. وجود الگوی باندی پلی مورفیک در استفاده از تکنیک های مورد بررسی نشان می دهد که سرعت بالایی از پلی مورفیسم در ژنوم سودوموناس آئروژینوسا وجود دارد و روش های مورد استفاده در این مطالعه هر کدام ابزارهایی قدرتمند در دسته بندی سودوموناس آئروژینوسا می باشند.